论文：
王思治，“‘太后下嫁疑案’辨证”，《历史研究》，2011年，02期。
王思治，“百尺竿头 更进一步”，《清史研究》，2008年，03期。
王思治、王春瑜、刘潞，“康熙 一个皇帝与一代朝风”，《紫禁城》，2006年，Z1期。
王思治，“‘潜心’与创新”，《创新科技》，2005年，12期；《温州医学院学报》，2002年，01期；《南方论刊》，2000年，10期。
王思治，“清代皇位继承制度之嬗变与满洲贵族间的矛盾”，7.5万字，《满学论丛》第3辑。
王思治，“康熙盛世简论”，《满学论丛》第5辑。
王思治，“施琅平台三题”，《明清论丛》第3辑。
王思治，“施琅平议”，《施琅与台湾》，社科文献出版社，2004年10月。
王思治，“避暑山庄的兴建与绥抚漠南蒙古”，《避暑山庄论丛》。
王思治，“‘鐍匣’与旻宁继统”，《清史研究》，2003年，04期。
王思治，“郑成功收复台湾及其领土主权意识”，《长共海涛说延平》，上海古籍出版社，2003年7月。
王思治，“简论清代的国家统一”，《光明日报》2000年9月29日
王思治，“清承明制说内阁”，《清史论丛》2000年号
王思治，“‘民生安危视吏治，吏治贪廉视督抚’”——简论清史吏治”，《历史科学与理论建设》，北师大出版社，1999年第4期 。
王思治：“康熙帝继位之谜”，（台湾）《历史》第138期，1999年7月
王思治、吕元骢，“施琅与清初统一台湾”，《清史研究》，1997年，01期。
王思治，“历史与史学”，《我的历史观》，广东人民出版社，1997年
王思治，“洪承畴降清评议”，《清史研究》，1996年，03期。
王思治，“英使马戛尔尼来华探析”，《中英通使二百周年学术讨论会论文集》，中国社科出版社，1996年
王思治、吕元骢，“18世纪前夜西北边疆局势述论”，《清史研究》，1995年，01期。
王思治，“读《袁崇焕研究论集》”，《北京社会科学》，1995年，04期。
王思治、刘凤云，“一部研究明清兴亡史的力作─—《满族崛起与明清兴亡》评介”，《清史研究》，1994年，01期。
王思治、吕元骢，“甲申之变与清军入关”，《清史研究》，1994年，02期。
王思治，“康熙朝索额图助皇太子‘潜谋大事’案”，（台湾）《历史》第74期，1994年3月
王思治，“李光地简论”，《清史研究》，1993年，01期。
王思治，“从避暑山庄说‘康乾盛世’——兼论布尔尼之叛与山庄的兴建”，《清史研究》，1993年，02期。
王思治，“皇太极研究中的几个问题”，《清代人物研究》，巴蜀书社，1992年。
王思治，“索额图其人——兼论助皇太子“潜谋大事””，《清史研究》，1992年，01期。
王思治、高欣峤，“一部成功的传记著作——读李治亭的《吴三桂大传》”，《清史研究》，1991年，03期。
王思治，“康熙的决策与昭莫多之战”，《史学月刊》，1991年，01期。
王思治，“十七世纪末西北边疆局势述论”，约7万字，《明清论丛》第1辑。
王思治、刘凤云，“论清初“遗民”反清态度的转变”，《社会科学战线》，1989年，01期。
王思治，“杰出的封建君主——康熙上”，《满族研究》，1987年，01期。
王思治，“杰出的封建君主——康熙下”，《满族研究》，1987年，02期。
王思治，“关于史学认识论问题的几点浅见”，《福建论坛文史哲版》，1987年，01期。
王思治，“康熙帝继位与四大臣辅政的由来”，《史学月刊》，1986年，06期。
王思治、李鸿彬，“论明清战争与清代社会矛盾”，《史学集刊》，1985年，02期。
王思治、李鸿彬，“明清之际的历史必须置于世界范围来考察”，《史学集刊》，1985年，03期。
王思治，“求学琐谈”，《教学与研究》，1985年，03期。
王思治，“皇太极嗣位与诸大贝勒的矛盾”，《历史档案》，1984年，03期。
王思治，“范文程评议”，《社会科学》，1984年，05期。
王思治，“皇太极研究中的几个问题”，《社会科学战线》，1984年，03期。
王思治、郭松义、南炳文、谢肇华，“中国首次清史讨论会学术综述”，《社会科学辑刊》，1983年，01期。
王思治、罗明，“关于清史研究的几个问题”，《文史哲》，1982年，01期。
王思治、韩大成，“尚钺同志的治学精神和主要学术观点”，《历史教学》，1982年，05期。
王思治，“多尔衮评议”，《社会科学战线》，1982年，04期。
王思治，“中国古代史分期问题分歧的原因何在?”，《历史研究》，1980年，05期。
王思治、金成基，“从清初的吏治看封建官僚政治”，《历史研究》，1980年，01期。
马汝珩、王思治，“土尔扈特蒙古西迁及其反抗沙俄压迫、重返祖国的斗争”，《社会科学战线》，1978年，03期。
王思治，“农民战争是封建社会生产关系和生产力矛盾的阶级表现——再与主张“两种革命论”的同志商榷”，《哲学研究》，1965年，03期。
王思治，“‘两种革命论’是‘无可非议’的吗?——与吉敦谕同志商榷”，《哲学研究》，1964年，06期。
王思治，“评《明代黄册制度》”，《历史研究》，1962年，03期。
王思治，“关于历史人物评价的意见—同吴晗同志商榷一个问题”，（合著汪原、袁定中）1962年6月17日。
王思治，“论汉代的‘公田’及其性质”，《教学与研究》，1961年，02期。
王思治，“东汉社会内部的主要矛盾”，《史学月刊》，1960年，01期。
王思治、李文海，“批判尚钺同志在历史研究中的修正主义观点”，《教学与研究》，1960年，01期。
王思治、林敦奎、贾岩，“评‘中国历史概要’”，《历史研究》，1956年，08期。
王思治，“再论汉代是奴隶社会”，《历史研究》，1956年，09期。
王思治、杜文凯、王汝丰，“关于两汉社会性质问题的探讨——兼评翦伯赞先生的‘关于两汉的官私奴婢问题’”，《历史研究》，1955年，01期。
论著：
《康熙事典》（合著冯尔康），紫禁城出版社，2010年。
《王思治自选集》，中国人民大学出版社，2007年。
《清朝通史》主编康熙朝分卷，紫禁城出版社，2003年。
《经文纬武定江山——康熙大帝》，万卷楼图书公司，2000年。
《避暑山庄与外八庙》，台湾万卷楼图书公司，2000年2月 。
《陈廷敬与皇城相府》主编，燕山出版社，2002年1月
《16－18世纪的中国社会》（联合国教科文组织世界各国学者撰写），本篇载于《人类史》第5卷，英国剑桥大学伯克教授主编，1998年在法国出版 。
《宗族制度简论等三篇》，载于日本和田正広编著的《中国传统社会の历史的特质》，日本中国书店1997年。
《清史论稿》，巴蜀出版社，1987年。
《承德避暑山庄》（合著），文物出版社，1980年 。
《两汉社会性质问题及其他》，三联书店，1980年。
《清代人物传稿》（上编）1.3.5.8卷主编，中华书局 。
《王思治自选集》目录
上编
中国古代史分期问题分歧的原因何在？
关于两汉社会性质问题的探讨
再论汉代是奴隶社会
三论汉代是奴隶社会——对《再论汉代是奴隶社会》一文的若干补充说明
试论封建社会的“清官”、“好官”
关于“清官”、“好官”讨论中的若干问题
再论“清官”
下编
清代前期历史地位论纲
甲申之变与清军人关
清代皇位继承制度之嬗变与满洲贵族问的矛盾
“太祖遗诏”之谜
康熙继位与孝庄文皇后改变“祖制”
康熙简论
清承明制说内阁
17世纪末西北边疆局势述论——噶尔丹分裂势力的兴亡
施琅与清初统一台湾
宗族制度浅论
陈廷敬简论
洪承畴降清评议
英使马戛尔尼来华探析
关于明清之际历史人物的评价问题
康乾“盛世”简论
避暑山庄的兴建与绥抚漠南蒙古
从避暑山庄说康乾“盛世”——兼论布尔尼之叛与山庄的兴建
“民生安危视吏治，吏治贪廉视督抚”——清代吏治简论
“鐍匣”与曼宁继统
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