《湛隐居士集跋》，1918年10月
《古今文鉴序》，1918年12月
《骨董琐记》8卷4册，1926年《明斋著书》排印本，1933年再版，1955年三版
《骨董续记》4卷2册，1933年《明斋著书》排印本，1955年北京三联书店再版
《骨董琐记全编》l册，内《琐记》8卷、《续记》4卷、《三记》4卷，1955年北京三联书店出版
《柳如是事辑序》，1930年11月
《槐居唱和集》，1932年单行本，1933年刊于《学衡》第79期
《与余季豫先生论晋雍碑中儋事珧》，1932年7月
《中国史大纲序》，1932年5月
《对公沙先生评夏曾佑<中国古代史>一文的质疑》，1934年4月21日，《大公报·图书副刊》23
《万历三大征考序》，1934年4月，《燕京大学图书馆丛书》本
《关于万历三大征考》，1934年8月18日，《大公报·图书副刊》40
《中国考试制度史序》，1934年12月
《中华二千年史上册》，1934年9月上海商务印书馆出版，1954年10月北京中华书局再版， 1956年12月第3版
《中华二千年史中册》，1934年10月上海商务印书馆出版，1954年10月北京中华书局再版，1956年12月第3版
《中华二千年史下册》，1956年4月北京中华书局出版，1958年1月再版
《护国军纪实》，《史学年报》1935年2卷2期，1939年又收入为《旧闻零拾》之第4种
《宋代太学生序》，1935年11月
《佳梦轩丛著序》，1935年《燕京大学图书馆丛书》铅印本
《汪悔翁乙丙日记序》，1935年《明斋丛刊》铅印本
《陈生彦文诔并序》，《史学年报》1936年2卷3期
《神庙留中奏疏汇要序》，《史学年报》1937年2卷4期，《燕京大学图书馆丛书》本
《谈军机处》（为燕京大学历史系座谈会讲，由王钟翰笔录），《史学年报》1937年2卷4期，又刊于《清史杂考》附录中
《官制沿革备论·论秦以后无真宰相上》，《史学年报》1938年2卷5期
《艺风诗词集跋》，1939年1月
《长安宫词序》，1939年5月，《旧闻零拾》铅印本
《祺祥故事序》，1939年6月，《旧闻零拾》铅印本
《天聪诏奏序》，1939年8月
《东陵道诗序》，1939年8月
《陈二庵先生行述》，1939年11月
《西园闻见录序》，1940年4月，《燕京大学图书馆丛书》本
《校印西园闻见录缘起》，1940年4月，哈佛燕京学社
《王君九九十寿序》，1941年10月
《汤住心七十寿序》，1941年10月
《与张孟劬书》，1941年12月
《辛壬纪事》，1942年10月
《静涛柏公传》，1943年5月
《临潢柏葰静涛守陵密记》，1943年9月，《中德学志》5：3
《滇语》，1943年10月
《陈二庵别传》，1944年1月
《英语呻吟语节录序》，1944年6月
《与松崎鹤雄书》，1944年7月
《陷虏记》，1945年8月
《闭关吟》，1946年6月，五石斋单行本
《南冠纪事》，1946年，刊于《现代知识》半月刊
《评三水梁燕孙先生年谱》，《燕京学报》1947年23期
《戊午科场大狱记》，1947年4月，刊于《益世报·史地周刊》37、38
《清季书院述略》，1947年6月，刊于《现代知识》半月刊
《皇朝掌故备要——桑园读书记之一》，1948年2月，刊于《益世报·史地周刊》79期
《张孟劬别传》，1948年6月
《题归来草堂录》，1949年载于《周叔弢先生六十生日纪念论文集》
《桑园读书记》，1955年，北京三联书店出版
《明斋题识》，1956年8月
《松堪小记》，1957年12月
《东林党籍考序》，1957年，中华书局出版
《云自在龛随笔序》，1958年6月，北京商务印书馆出版
《五石斋题跋》，1958年5月
《锡文诚公奏议序》，1958年，中国科学院近代史研究所编印
《东京梦华录注》，1959年1月，北京商务印书馆出版
《永宪录跋》，1959年8月，北京中华书局出版
《北游录跋》，1960年4月，北京中华书局出版
《清诗纪事初编》，1965年11月，中华书局上海编辑所出版
以下各篇著作年月不详
《天桥志序》
《沈廷扬事证》
《皇清通志纲要序》
《清代画史补录序》
《松月堂目下旧见序》
《南雷文约序》
《汉唐文持序》
（资料来源：王钟翰、邓珂《邓之诚先生传略》，载《中国当代社会科学家》第4辑，书目文献出版社1983年版，中华文史网整理。）